气相色谱–质谱联用仪(GC-MS)是分析仪器届最为普遍的联用技术。事实上，从数量上看，气质联用仪是安装量最多的质谱系统。气质联用仪种类多样，并可应用于许多不同行业，尤其是在环境、化学和毒理学领域用途很广。不过，气质联用仪的市场是一个成熟的市场，其销售主要来自于旧系统更新和售后部分;除此之外，GC-MS系统销售的增长一部分来源于实验室用GC-MS来取代原来的气相色谱(GC)系统。

　　气质联用仪的质量分析器主要有四极杆、离子阱、磁质谱、和飞行时间四种。由于四极杆质量分析器可靠、经济，为多数应用提供皮实稳定的解决方案，因此四极杆是目前最为通用的质量分析器。然而，追求更低检测限和更高分辨率的应用日趋增长，因此，市场上对其它种类气质联用仪质量分析器的需求也在迅速增长。

　　磁质谱是最古老的质谱技术，可提供高重现性的结果，并具有高分辨率和高灵敏度。离子阱则因其高灵敏度和易维护的特点在市场上得到日益广泛的认可。离子阱气质联用仪式是一种串联式的质谱仪，串联技术提高了混合物分析中的选择性，降低了检测限，并且能够提供物质结构方面的信息，这非常适合应用于法医和生命科学领域，尤其是在药物发现、合成和代谢研究方面。

　　飞行时间质量分析器在所有的质量分析器中是最快的，并具有实用上最宽的质量范围。气相-飞行时间系统(GC-TOF)相对价格较高，最便宜也要15 万美元。不过，大多数认同这项技术的人认为气相-飞行时间系统是绝对值得投资的。

　　全球气质联用仪超过三分之二的市场被排名前五的行业占据，这五个行业分别为通用/环境测试、农业和食品、石油和燃气、政府测试部门和学术机构，而化工、医药、政府研究部门和CRO等领域对气质联用仪的需求量相对较少。